Biomedical Data Sciences

De afdeling Biomedical Data Sciences verzorgt onderwijs in het Geneeskunde en Biomedische Wetenschappen curriculum:

• Medische Statistiek;
• Data Management;
• Moleculaire Epidemiologie;
• En Medische Besliskunde

De afdeling biedt cursussen aan in het Masterplus programma, voor medische onderzoekers van binnen en buiten het LUMC.

Daarnaast geeft de sectie Medische Statistiek een deel van het onderwijs in de Master Statistics & Data Science en  in de Master Population Health Management. 

Stages en afstudeerprojecten

De afdeling Biomedical Data Sciences biedt stage- en afstudeerprojecten aan voor studenten Geneeskunde, Biomedische Wetenschappen, (Medische) Biologie, Bioinformatica/Data Science, Statistiek (en eventueel uit andere richtingen zoals Psychologie). Ook voor HBO studenten zijn projecten beschikbaar.

Contactpersonen hiervoor zijn:

• dr. Eline Slagboom (Moleculaire Epidemiologie)
• Roula Tsonaka (Medische Statistiek)
• Dr. Anne Stiggelbout (Medische Besliskunde)
• Dr. K.M. van der Pal (Advanced Data Management)

Medische Statistiek

• prof. dr. E.W. (Ewout) Steyerberg (Afdelingshoofd)
  klinische biostatistiek
  medische besliskunde
  focus op predictiemodellen
• L. (Leonie) Oudshoorn (Managementassistent)
  medische statistiek
  advanced data management
• dr. S. (Stefan) Böhringer (Assistant professor)
  statistical genetics
  computational statistics
  high-performance computation & automated analysis
• drs. E.F. (Edouard) Bonneville (PhD Student)
  Survival analysis
  Competing risks and multi-state models
  Missing data
  Infectious disease modelling / forecasting
• S. (Said) el Bouhaddani (PhD Student)
  high dimensional statistics
  data integration
  latent variable modeling
  meta analysis and imputation in high dimensions
• prof. dr S. (Saskia) le Cessie (Full professor of statistical methods in clinical epidemiology)
  epidemiology
  medical statistics
  observational studies
  causal inference
• dr. X. (Xu) Chen
  fMRI data analysis
  multiple testing
• drs. C. (Chengyuan) Lu
• M. (Mitra) Ebrahimpoor
• prof. dr. M. (Marta) Fiocco (Hoogleraar Toegepaste Wiskunde)
  medical Statistics
  survival analysis
  meta analysis
  frailty models
  counting processes
• A.M. (Angga Muhamad) Fuady (PhD Student)
  statistical genetics
  RNA Sequencing Analysis
  statistical modeling
• dr. ir. N. (Nan) van Geloven (biostatisticus)
  survival analysis
  causal inference
  dynamic prediction
  clinical trials
  evaluation of treatment timing
• prof. dr. J. (Jelle) Goeman (Hoogleraar Biostatistiek)
  hoog-dimensionele data
  meervoudig hypothesetoetsen
  regression met veel variabelen
  statistische bioinformatica
• dr. S.M. (Szymon) Kielbasa (Assistant Professor, Coordinator of Bioinformatics Center for Expertise)
• I. (Ivonne) Martin (PhD Student)
  human - gut microbiome
  repeated - measurement study
  joint modelling of mixed outcomes
• dr. B. (Bart) Mertens (Biostatistician)
  statistical methods for high-dimensional omics (proteomics, metabolomics, lipidomics)
  prediction with missing values
  bayesian statistics
• drs. R. (Ramin) Monajemi (Senior researcher)
  bio-informatica
• drs. X. (Ningning) Xu
• drs. S. (Susanne) Pinto
• prof. dr. H. (Hein) Putter (Hoogleraar, wetenschappelijk staflid)
  medische statistiek
• dr. M.D.M. (Mar) Rodriguez-Girondo (Assistant Professor)
  medical statistics
  prediction and classification with omics data
  survival analysis
  family data
• dr. S. (Roula) Tsonaka (Statistician)
  models for longitudinal omics
  RNAseq
  analysis of clustered data (e.g. families)
  genetic association studies: gene-set/pathway-based analyses
• prof. dr. J. (Jacco) Wallinga (Professor modellering van infectieziekten)
  statische analyse van infectieziekten gegevens
• dr. L.C. (Liesbeth) de Wreede (statisticus)
  medische statistiek
  survivalanalyse
  competing risks en multi-state modellen
  klinische studies in de hematologie
• dr. E.W. (Erik) van Zwet (Associate professor)
  medische statistiek
  meta-science

Moleculaire Epidemiologie

• prof. dr. P.E. (Eline) Slagboom (Sectiehoofd van de Moleculaire Epidemiologie)
  moleculaire epidemiologie
  genetica
  metabolomics
  verouderingsonderzoek
• I.C.M. (Inge) ten Hoorn (Managementassistent)
  moleculaire epidemiologie
• prof. dr. I. (Ingrid) Meulenbelt (Hoogleraar Moleculaire Biologie van Artrose)
  moleculaire epidemiologie
  genetica
  artrose
• dr. ir. E.B. (Erik) van den Akker (Universitair Docent Bioinformatica)
  moleculaire epidemiologie
  leiden computational biology center (LCBC)
• dr. M. (Marian) Beekman (Senior Onderzoeker)
  moleculaire epidemiologie
  Biomarkers voor gezonde veroudering
  metabolomics
  Leiden Langleven Studie (verouderingsonderzoek)
  genoomwijde associatie studies
  genoomwijde linkage studies
  gen expressie
  biobanking
• drs. N.M.A. (Niels) van den Berg (AIO)
  Multigenerational family studies
  Demography
  Genealogy
  Social history
  Healthy Ageing
  Statistics
  Genetics
• D. (Daniele) Bizzarri, MSc (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  longevity
• N.G.C. (Niek) Bloks (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  artrose
• F.A. (Fatih) Bogaards (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  verouderingsonderzoek
• I. (Ilja) Boone, MSc (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  artrose onderzoek
• ing. D. (Davy) Cats (Bio-Informaticus)
  bio-informatica
  sequencing analysis support core (SASC)
• dr. R. (Rodrigo) Coutinho de Almeida (Post-doctoraal Onderzoeker)
  bio-informatica
  artrose
• drs. K.F. (Koen) Dekkers (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  epigenetica
• Prof. dr. B.T. (Bas) Heijmans (Professor of Population Epigenomics)
• drs. M. (Marcella) van Hoolwerff (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  artrose
• drs. E. (Evelyn) Houtman (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  artrose
• Dr. N.M.(Nicoline) Korthagen (Postdoctoraal Onderzoeker)
  moleculaire epidemiologie
  artrose
  inflammatie
  biomarkers
  ziekte modellen
• ing. N. (Nico) Lakenberg
  moleculaire epidemiologie
• dr. H. (Leon) Mei (Manager Sequencing Analysis Support Core - SASC)
  moleculaire epidemiologie
  sequencing analysis support core (SASC)
• drs. S. (Stelios) Paraschiakos (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  data management
  verouderingsonderzoek
• dr. Y.F.M. (Yolande) Ramos
  moleculaire epidemiologie
  onderzoeker
• drs. N. (Nathalie) Reilly (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  hart- en vaatziekten
• prof. dr. M.J.T. (Marcel) Reinders (Hoofd Leiden Computational Biology Center - LCBC)
• Alejandro Rodriguez Ruiz MSc (AIO)
  moleculaire epidemiologie
• L.J. (Lucy) Sinke (AIO)
  moleculaire epidemiology
  bioinformatics
  cardiovascular disease
• dr. E. (Evie) van der Spoel (Post-doctoraal Onderzoeker)
• drs. H.E.D. (Eka) Suchiman
  moleculaire epidemiologie
• R.G.M. (Ritchie) Timmermans (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  artrose
• P. (Pia) Todtenhaupt (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  epigenetics
  TwinLife
• M. (Margo) Tuerlings (AIO)
  moleculaire epidemiologie
  artrose
• dr. D. (Dina) Vojinovic-Dees (Postdoctoraal Onderzoeker)
• R.H.P. (Ruben) Vorderman (Bio-informaticus)
  bio-informatica
  sequencing analysis support core (SASC)
• drs. J.S. (Joyce) Vriezen (Programma manager)
  Programma manager VOILA
• M.A.W. (Mathew) Nickel (AIO)

Medische Besliskunde

• prof. dr. E.W. (Ewout) Steyerberg (Afdelingshoofd)
  klinische biostatistiek
  medische besliskunde
  focus op predictiemodellen
• A.N. (Aubry) Leiwakabessy (Managementassistent)
  medische besliskunde
  onderwijsondersteuning en -coördinatie
  websitebeheer en contentcreatie
• prof. dr. A.M. (Anne) Stiggelbout (Hoogleraar Medische Besliskunde)
  medische besliskunde
  patient preferenties
  gedeelde besluitvorming
  risico perceptie en risico communicatie
  klinimetrie
  psychometrie
• prof. dr. M.W.J.M. (Michel) Wouters (Hoogleraar Kwaliteit van de oncologische zorg)
  datagedreven verbetering van patiëntuitkomsten
  uitkomstonderzoek
  'real world data' analyses
  kwaliteitsinstrumenten medisch specialistisch zorg
  clinical auditing
  waardegedreven zorg (VBHC)
• dr. M.E. (Elske) van den Akker-van Marle (Gezondheidseconoom)
  gezondheidseconomie
  kosten-effectiviteitsanalyses
  kwaliteit van leven onderzoek
  ontwikkeling uitkomstmaten
• dr. L. (Leti) van Bodegom-Vos (Implementatiedeskundige)
  implementatie
  de-implementatie
  kwaliteit van zorg
• J. (Nanny) van Duijn-Bakker (onderzoeksassistent)
• J.M. (Jan) Heijdra Suasnabar (Researcher)
  economische evaluaties
  survival analyse
• dr. W.B. (Wilbert) van den Hout (Gezondheidseconoom)
• S.M. (Sascha) Keij (OIO)
  gedeelde besluitvorming
  arts-patiënt communicatie
  gezondheidspsychologie
• M. (Martha) Kidanemariam (arts-onderzoeker)
  waardegedreven zorg
  patiëntgerichte zorg
  gedeelde besluitvorming
• A.A. (Anouk) Kruiswijk (OIO)
  wekedelen tumoren
  risico-predictiemodellen
  personaliseren van zorg
• dr. P.J. (Perla) Marang-van de Mheen (Epidemioloog)
  kwaliteit van zorg
  patient veiligheid
• dr. A.H. (Arwen) Pieterse (Communicatieonderzoeker)
  behandelvoorkeuren patiënten en zorgverleners
  besluitvorming over behandeling
  gedeelde besluitvorming
  arts-patiënt communicatie
• E.K.J. (Esmée) van der Poort (OIO)
  ziekenhuiskosten
  waardegedreven zorg
  kosten-effectiviteitsanalyses
  gezondheidseconomie
• J.K. (Jaap) Sont (associate professor)
  mHealth / eHealth
  patient registries
  patient centered care
  asthma, diabetes mellitus
• D. (Dorine) van Staalduinen (OIO)
  value-based healthcare
  healthcare governance
  interprofessional collaboration
• dr. T.H. (Thomas) Wieringa (Onderzoeker)
  patiënt-gecentreerde zorg
  gedeelde besluitvorming
  patiënt-gerapporteerde uitkomsten
  diabetes mellitus
  kanker
• dr. A. (Anke) Woudstra (Onderzoeker)
  medische besliskunde
  geïnformeerde besluitvorming
  gedeelde besluitvorming
  gezondheidsvaardigheden
  screening
  klinimetrie

Advanced Data Management

• dr. K.M. (Karin) van der Pal-de Bruin (Hoofd Sectie Advanced Data Management)
  datastewardship
  good research data management
  epidemiologie
  Castor en ProMISe
  privacy
  GRP
  FAIR data
  datamanagementplannen
• L. (Leonie) Oudshoorn (Managementassistent)
  medische statistiek
  advanced data management
  dr. ir. T.M. Jansen (specialist medical research datamanagement)
  good research datamanagement
  database ontwerp
  Castor en ProMISe datamanagementsystemen
  klinische trials
  neurochirurgie clinical trials (SIPS groep)
  onderwijs in datamanagement
• drs. K.R. (Karen) Kooijman (Designer medical research data management)
  good research data management
  database ontwerp
  Castor en ProMISe datamanagementsystemen
• dr. ir. J. (Judith) Mannien (Coordinator medical research datamanagement)
  good research data management
  datastewardship
  FAIR data
  database ontwerp
  datamanagementplannen
  good research practice (GRP)
  privacy
  Castor en ProMISe datamanagementsystemen
  epidemiologie
  dataopschoning
  onderwijs in datamanagement
• dr. M.J.C. (Martiene) Moester (Specialist medical research datamanagement)
  data stewardship
  good research data management
  FAIR data
  datamanagementplannen
  privacy
  sleutelbestanden, pseudonimiseren
  database ontwerp
  Castor en ProMISe datamanagementsystemen
  parelsnoer
• dr. K. (Kristel) Schaap (Specialist medical research data management)
  database design
  good research data management
  dataopschoning
  Castor en ProMISe datamanagementsystemen
  Research Support Desk
  onderwijs
• H.P. (Henk Pieter) Sierat (ICT Ontwikkelaar)
  databases
  koppelingen
  conversies
  programmeren
• dr. N.R. (Niek) van Ulzen (Specialist medical research datamanagement)
  FAIR data
  datastewardship
• dr. I. (Ineke) van der Veen (Coordinator medical research datamanagement)
  good research data management
  datastewardship
  FAIR data
  database ontwerp
  datamanagementplannen
  good research practice (GRP)
  privacy
  Castor en ProMISe datamanagementsystemen
  epidemiologie
  klinische trials
  dataopschoning
  onderwijs in datamanagement
  biobanken
• R. (Rogier) van der Velde (Informatieanalist)
  good research data management
  database ontwerp
  privacy
  Castor en ProMISe datamanagementsystemen
  dataopschoning
• D.C.M. (Dominique) Wanders, MSc (Specialist medical research datamanagement)
  good research datamanagement
  datastewardship
  FAIR data
  database ontwerp
  datamanagementplannen
  good research practice (GRP)
  privacy
  Castor en ProMISe datamanagementsystemen
  epidemiologie
  klinische trials
  dataopschoning
  onderwijs in datamanagement
• R.E. (Richard) Zwaan (Designer medical research datamanagement)
  Database design
  Data uploads
  Castor and ProMISe data management systemen
  Klinische trials
  Privacy
  ProMISe user cursussen