Erfelijke borst- en/of ovariumkanker (HBOC – hereditair borst- en/of ovarium carcinoom)
| Gen | Technieken |
| ATM | Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 63) inclusief intron/exon overgangen |
| BRCA1 | Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2,3 en 5 t/m 24) inclusief intron/exon overgangen. MLPA (MRC-Holland kit P002-D1) voor de detectie van deleties en duplicaties. |
| BRCA2 | Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 27) inclusief intron/exon overgangen. |
| CHEK2 | Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 15) inclusief intron/exon overgangen |
| PALB2 | Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 1 t/m 13) inclusief intron/exon overgangen |
| BRIP1 | Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 20) inclusief intron/exon overgangen |
| RAD51C | Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 1 t/m 9) inclusief intron/exon overgangen |
| RAD51D | Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 1 t/m 10) inclusief intron/exon overgangen |
Procedure :
Bij aanvraag voor bevestiging diagnose erfelijke borst- en/of ovariumkanker (HBOC) worden standaard de 5 genen ATM, BRCA1, BRCA2, CHEK2 en PALB gelijktijdig ingezet, tenzij anders is aangegeven. Uitsluitend voor het BRCA1 gen wordt standaard een MLPA test voor de detectie van copy number variants (CNV’s) ingezet.
Op speciaal verzoek wordt ook de MLPA (exon 2 t/m 27 (MRC-Holland kit P045-C1 BRCA2/CHEK2)) voor de detectie van CNV’s in het BRCA2 gen uitgevoerd. De BRCA2 MLPA bevat tevens een mutatie-specifieke test voor de pathogene founder variant (risicofactor) c.1100del p.(Thr367Metfs*15), die eveneens bekend is als c.1100delC of 1100delC en die gelegen is in exon 11 van het CHEK2 gen.
Sequentie-analyse van de genen BRIP1, RAD51C en RAD51D wordt uitsluitend ingezet op speciaal verzoek van de aanvragend klinisch geneticus, wanneer er sprake is van een zeer sterke verdenking op HBOC. Deze genen werden aanvankelijk als ovariumkanker-gevoeligheidsgenen beschouwd, maar lijken ook betrokken te zijn bij erfelijke borstkanker.
Detectie ratio:
Pathogene mutaties:
ATM: ca. 2%
BRCA1: 3-6%
BRCA2: 2-4%
PALB2: nog onbekend
BRIP1, RAD51C, RAD51: nog onbekend; wrs. ca. 1%
Varianten waarvan de klinische betekenis niet duidelijk is:
ATM: ca. 5%
BRCA1: 4-6%
BRCA2: 8-10%
PALB2: nog onbekend
BRIP1, RAD51C, RAD51: nog onbekend; wrs. ca. 1%
| Gen | Genproduct | Locus | Overerving | OMIM nummer | Referentiesequentie |
| ATM | ATM (Ataxia-Telangiectasia Mutated gene, serine/threonine kinase) | 11q22 | Autosomaal dominant * | #607585 | NM_00051.3 |
| BRCA1 | BRCA1 | 17q21 | Autosomaal dominant | #113705 | NM_007294.3 |
| BRCA2 | BRCA2 | 13q12.3 | Autosomaal dominant | #600185 | NM_000059.3 |
| CHEK2 | Checkpoint kinase 2 | 22q12.1 | Risico factor | #604373 | NM_007194.3 |
| PALB2 | PALB2 (Partner And Localizer of BRCA2) | 16p12.2 | Autosomaal dominant | #610355 | NM_024675.3 |
| BRIP1 | BRCA1-Interacting Protein 1 | 17q23.2 | Autosomaal dominant | #605882 | NM_032043.2 |
| RAD51C | RAD51 paralog C | 17q22 | Autosomaal dominant | #613399 | NM_058216.2 |
| RAD51D | RAD51 paralog D | 17q12 | Autosomaal dominant | #614291 | NM_002878.3 |
homozygotie of samengestelde heterozygotie voor pathogene varianten in het ATM gen is geassocieerd met het autosomaal recessieve ziektebeeld ataxia-telangiectasia (OMIM # 208900), dat gekenmerkt wordt door neurologische afwijkingen, immuundefecten en een predispositie voor maligniteiten zoals leukemie, lymfomen en bepaalde hersentumoren.
Website links
Patiënten materiaal insturen
Uitslagtermijnen laboratoriumonderzoek
Databases / links:
Nationale database met alle varianten gevonden in de Nederlandse en Belgische DNA diagnostiek laboratoria.
LOVD3, ATM: https://databases.lovd.nl/shared/genes/ATM
LOVD3, BRCA1: https://databases.lovd.nl/shared/genes/BRCA1
LOVD3, BRCA2: https://databases.lovd.nl/shared/genes/BRCA2
LOVD3, CHEK2: https://databases.lovd.nl/shared/genes/CHEK2
LOVD3, PALB2: https://databases.lovd.nl/shared/genes/palb2
Internationale databases: