Postdoc – Multimodale uitlegbare AI voor vroege detectie en risicostratificatie bij familiaire hypercholesterolemie

Wat ga je doen?

Met jouw onderzoek draag je bij aan de ontwikkeling van nieuwe risicobeoordelings- en patiëntstratificatie-instrumenten voor familiaire hypercholesterolemie (FH). Dit omvat het identificeren van nieuwe factoren die bijdragen aan de progressie van de ziekte. De primaire focus ligt op het gebruik van geavanceerde deep learning-modellen voor hoog-dimensionale data, in combinatie met andere machine learning-technieken voor andere typen data, om voorspelmodellen te bouwen. Voor elke datamodaliteit ontwerp je een geschikte (deep) machine learning-architectuur om voorspellende kenmerken te extraheren. In de volgende fase ontwikkel en pas je post-hoc uitlegbaarheidsmethoden toe, waaronder technieken zoals “activation maps” en “this looks like that”-benaderingen, om te onderzoeken welke kenmerken het meest bijdragen aan de voorspellingen van het model. Je werkt met bestaande FH-patiëntencohort gegevens uit Frankrijk, Portugal, Tsjechië en Turkije, die worden uitgebreid met multi-level multi-omics data, waaronder genetische, transcriptomics, metabolomics en cellulaire gegevens.

Je kernonderzoekstaken omvatten:

• Het mede-ontwikkelen en toepassen van (uitlegbare) AI technieken (in het bijzonder deep learning).
• Het schrijven van wetenschappelijke artikelen voor publicatie in toonaangevende tijdschriften.
• Het presenteren van je onderzoeksresultaten op internationale conferenties.

Naast je kernonderzoekstaken stel je voortgangsrapportages op en presenteer je projectupdates tijdens interne consortiumvergaderingen en externe beoordelingsbijeenkomsten. Je vertegenwoordigt bovendien jouw werkpakket binnen het consortium, niet alleen tijdens formele bijeenkomsten, maar ook via voortdurende communicatie met partners uit verschillende disciplines en instellingen. Het actief bewaken van de afstemming en integratie van jouw werkpakket met de bredere projectdoelstellingen zal essentieel zijn voor het succes van het project.

Waar ga je werken?

Deze functie is beschikbaar binnen het FH-EARLY project, getiteld “New strategies for the early diagnosis, risk stratification and co-management of familial hypercholesterolemia”. Dit FH-EARLY project wordt gefinancierd binnen het Horizon Europe-programma, in het kader van de HORIZON Research and Innovation Actions (HORIZON-RIA), onder de call: “Comparative effectiveness research for healthcare interventions in areas of high public health need - Tackling diseases and reducing disease burden” (HORIZON-HLTH-2024-DISEASE-03-08-two-stage).

Met een consortium van 15 internationaal toonaangevende instellingen is dit Horizon Europe-project van 48 maanden gestart in januari 2025, met als doel het mogelijk maken van nieuwe strategieën voor eerdere diagnose en co-behandeling van familiaire hypercholesterolemie (FH).

Op het LUMC sluit je je aan bij de onderzoeksgroep AI-based Innovations binnen de afdeling radiotherapie. Jouw werk maakt deel uit van een project dat bijdraagt aan onze onderzoeksfocus op uitlegbare AI (explainable AI). Daarmee word je ook onderdeel van het nationale Innovation Center for AI (ICAI) lab op het gebied van “explainable AI for health”. Binnen dit project wordt van je verwacht dat je nauw samenwerkt met een andere postdoc die zal worden aangesteld bij het Centrum Wiskunde & Informatica (CWI).

Wat neem je mee?

Je hebt een oprechte interesse in zowel fundamenteel als toegepast onderzoek. Je bent flexibel, gemotiveerd en werkt graag samen met collega’s uit verschillende vakgebieden. Communicatie gaat je goed af, net als het organiseren van je werkzaamheden. Dankzij jouw nieuwsgierigheid en enthousiasme voel je je thuis in een multidisciplinaire omgeving en zoek je actief verbinding, bijvoorbeeld binnen een groot Europees consortium en in samenwerking met collega’s bij het CWI.

Verder heb je:

• een PhD (of zit je in de afrondende fase daarvan) in informatica, data science, bio-informatica, computationele biologie of een verwant vakgebied.
• aantoonbare ervaring met programmeertalen en tools die gangbaar zijn in de bio-informatica of data science.
• praktische ervaring met het analyseren van hoog-dimensionale data.
• uitstekende mondelinge en schriftelijke beheersing van het Engels.

Wat bieden we jou?

Door gezondheid gedreven; dat is onze missie. Dit geldt uiteraard niet alleen voor onze patiënten maar ook voor onze medewerkers. We streven naar een veilige, inclusieve en gelijkwaardige werkomgeving waarin talentontwikkeling en verbindend leiderschap centraal staan. Om te kunnen blijven leren en ontwikkelen bieden wij interne opleidingen en bijscholing aan. Daarnaast heb je recht op een eindejaarsuitkering (8,3%), vakantiegeld, fietsregeling, sportbudget, thuiswerkvergoeding en een uitstekende reiskostenregeling voor woon-werkverkeer. Ook ben je als medewerker van het LUMC aangesloten bij het ABP pensioenfonds. Dit betekent dat maar liefst 70% van je pensioenpremie betaald wordt door het LUMC en je daardoor netto meer salaris over houdt. Wel zo fijn!  

Bekijk alle arbeidsvoorwaarden van het LUMC.

Waar staan wij voor?

Als academisch medisch centrum streeft het LUMC naar een medewerkersbestand dat een goede afspiegeling is van de samenleving. Wij zetten ons in voor de hoogste kwaliteit op het gebied van gezondheidszorg, onderwijs en (internationaal) onderzoek, waarbij diverse perspectieven van cruciaal belang zijn. Duurzaamheid staat bij ons ook hoog in het vaandel: we zetten ons in voor een gezonde toekomst, niet alleen voor mensen, maar ook voor de planeet. In lijn met deze waarden willen we een creatieve en inspirerende werkplek zijn, waar het voor ons van essentieel belang is dat iedereen zich thuis, veilig en erkend voelt. Bij ons draait het om wie je bent en wat je bijdraagt, ongeacht je achtergrond. Samen werken wij aan een duurzame en inclusieve toekomst, zowel voor de mensen om ons heen als voor de wereld waarin we leven. Samen zijn wij LUMC.  

Meer informatie

• Als gedreven postdoc bedraagt je salaris minimaal € 3.598,- en maximaal € 5.669,- bruto per maand (schaal 10, CAO UMC). Deze bedragen zijn op basis van een fulltime dienstverband.
• De procedure omvat verschillende fasen, de eerste fase zal in de eerste twee weken van augustus plaatsvinden en betreft een sollicitatiegesprek met Tanja Alderliesten (LUMC) en Peter A.N. Bosman (CWI) waarvoor je gevraagd zal worden om een presentatie te geven.
• De sollicitatie dient de volgende documenten te bevatten:
  • Een motivatiebrief, waarin je persoonlijke motivatie en geschiktheid voor de functie worden toegelicht (maximaal twee A4).
  • Een gedetailleerd curriculum vitae, inclusief contactgegevens van drie referenten.
  • Overzicht van gevolgde vakken (op M.Sc.-niveau) met behaalde cijfers.
• De sollicitatiegesprekken zullen in de eerste helft van augustus gehouden worden.
• De gewenste startdatum is 1 januari 2026. Een latere startdatum is niet mogelijk. Een eerdere startdatum is bespreekbaar.
• Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.