Paragangliomen en/of feochromocytomen
OMIM | Aandoening | Gen |
168000 | Erfelijke paragangliomen (PGL1) | SDHD |
115310 | Erfelijke paragangliomen (PGL4) | SDHB |
605373 | Erfelijke paragangliomen (PGL3) | SDHC |
614165 | Erfelijke paragangliomen (PGL5) | SDHA |
601650 | Erfelijke paragangliomen (PGL2) | SDHAF2 |
(144700) | Erfelijk Niercelcarcinoom (RCC) | SDHB, VHL, SDHD |
171300 | Erfelijke feochromocytomen | SDHB, SDHC, SDHD, MAX, TMEM127, RET, VHL |
606864 | Paragangliomen en Gastrointestintianale stromale tumoren (GIST); Carney-Stratakis Syndroom | SDHA, SDHB, SDHD |
Gen | Technieken |
SDHD | -Sequentie analyse exon 1 t/m 4 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden). -MLPA van promoter, exon 1 t/m 4 (P226-C1 kit, MRC-Holland) |
SDHB | -Sequentie analyse exon 1 t/m 8 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden) -MLPA van exon 1 t/m 8 (P226-C1 kit, MRC-Holland) |
SDHC | -Sequentie analyse exon 1 t/m 6 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden) -MLPA van promoter, exon 1 t/m 6 (P226-C1 kit, MRC-Holland). |
SDHA | -Sequentie analyse exon 1 t/m 15 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden) |
SDHAF2 | -Sequentie analyse exon 2, inclusief flankerende intron gebieden. Alleen in exon 2 is een pathogene mutatie bekend. -Bij aanvraag van het Genpanel (‘op aanvraagformulier PGL-panel): -sequentie analyse van exon 1 t/m exon 4 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden) -MLPA exon 1 t/m 4 (P226-C1 kit, MRC-Holland). |
MAX | -Sequentie analyse exon 1 t/m 5 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden) |
TMEM127 | -Sequentie analyse exon 1 t/m 4 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden) |
RET | -Sequentie analyse exon 10,11,13,14,15 en 16 , inclusief flankerende intron gebieden |
VHL | -Sequentie analyse exon 1, 2 en 3 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden) -MLPA van exon 1 t/m 3 (P016-C2 kit, MRC-Holland) |
Procedure :
Indien de mutatie nog niet bekend is worden alle specifiek aangevraagde genen tegelijk ingezet, tenzij anders is aangegeven. Per gen wordt zowel sequentie analyse als MLPA standaard uitgevoerd (uitzondering:SDHAF2, zie tabel hierboven). Bij aanvraag voor gelijktijdige analyse van 3 of méér genen wordt het complete genpanel “Paragangliomen en/of feochromocytomen (PGL-panel)” ingezet.
Detectie ratio:
Dit is een klinisch zeer heterogene groep patiënten. De detectie ratio voor pathogene mutaties : SDHD in 35% van de patiënten, SDHA 9%, SDHB 7%, en SDHC 0,8%. SDHAF2 , TMEM127, MAX, VHL en RET zijn in een te kleine groep patienten onderzocht om hier een representatieve detectie ratio te geven.
Gen | Genproduct | Locus | Overerving | OMIM nummer | Referentiesequentie |
SDHD | Succinate dehydrogenase complex, subunit D | 11q23.1 | Autosomaal dominant, alleen verhoogd risico op tumoren indien de mutatie van vader komt | 602690 | NT_033899.7 NM_003002.2
|
SDHB | Succinate dehydrogenase complex, subunit B | 1p36.13 | Autosomaal dominant | 185470 | NT_004610.18 NM_003000.2
|
SDHC | Succinate dehydrogenase complex, subunit C | 1q23.3 | Autosomaal dominant | 602413 | NT_004487.18 NM_003001.3 |
SDHA | Succinate dehydrogenase complex, subunit A | 5p15.33 | Autosomaal dominant | 600857 | NC_000005.9 NM_04168.2 |
SDHAF2 | Succinate dehydrogenase Complex Assembly Factor 2 | 11q12.2 | Autosomaal dominant, alleen verhoogd risico op tumoren indien de mutatie van vader komt | 613019 | NC_000011.9, NM_017841.1
|
MAX | MYC Associated Factor X | 14q23.3 | Autosomaal dominant, waarschijnlijk alleen verhoogd risico op tumoren indien de mutatie van vader komt | 154950 | NG_029830.1, NM_002382.3 |
TMEM127 | TransMembrane protein 127 | 2q11.2 | Autosomaal dominant | 613403 | NG_027695.1, NM_017849.3 |
RET | Rearranged during transfection protooncogene | 10q11.21 | Autosomaal dominant | 164761 | NC_000010.10, NM_020975.4 |
VHL | VHL gene | 3p25.3 | Autosomaal dominant | 608537 | NC_000003.12, NM_000551.3 |
Website links:
Uitslagtermijnen laboratoriumonderzoek
Databases / links:
www.LOVD.nl/SDHD ; www.LOVD.nl/SDHB; www.LOVD.nl/SDHC; www.LOVD.nl/SDHA; www.LOVD.nl/SDHAF2; www.lovd.nl/MAX; www.LOVD.nl/TMEM127; www.lovd.nl/VHL; www.lovd.nl/RET