Paragangliomen en/of feochromocytomen


OMIM

Aandoening

Gen

168000

Erfelijke paragangliomen (PGL1)

SDHD

115310

Erfelijke paragangliomen (PGL4)

SDHB

605373

Erfelijke paragangliomen (PGL3)

SDHC

614165

Erfelijke paragangliomen (PGL5)

SDHA

601650

Erfelijke paragangliomen (PGL2)

SDHAF2

(144700)

Erfelijk Niercelcarcinoom (RCC)

SDHB, VHL, SDHD

171300

Erfelijke feochromocytomen

SDHB, SDHC, SDHD,  MAX, TMEM127, RET, VHL

606864

Paragangliomen en Gastrointestintianale stromale tumoren (GIST);  Carney-Stratakis  Syndroom

SDHA, SDHB, SDHD


Gen

Technieken

SDHD

-Sequentie analyse exon 1 t/m 4 (gehele coderende sequentie, inclusief  flankerende intron gebieden).

-MLPA van promoter, exon 1 t/m 4 (P226-C1 kit, MRC-Holland)

SDHB

-Sequentie analyse exon 1 t/m 8 (gehele coderende sequentie, inclusief  flankerende intron gebieden)

-MLPA van exon 1 t/m 8 (P226-C1 kit, MRC-Holland)

SDHC

-Sequentie analyse exon 1 t/m 6 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden)

-MLPA van promoter, exon 1 t/m 6 (P226-C1 kit, MRC-Holland).

SDHA

-Sequentie analyse exon 1 t/m 15 (gehele coderende sequentie, inclusief  flankerende intron gebieden)

SDHAF2

-Sequentie analyse exon 2, inclusief flankerende intron gebieden. Alleen in exon 2 is een pathogene

  mutatie bekend.

-Bij aanvraag van het Genpanel (‘op aanvraagformulier PGL-panel):

     -sequentie analyse van exon 1 t/m  exon 4  (gehele coderende sequentie, inclusief  flankerende intron

      gebieden)

     -MLPA exon 1 t/m 4 (P226-C1 kit, MRC-Holland).

MAX

-Sequentie analyse exon 1 t/m 5 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden)

TMEM127

-Sequentie analyse exon 1 t/m 4 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden)

RET

-Sequentie analyse exon 10,11,13,14,15 en 16 , inclusief flankerende intron gebieden

VHL

-Sequentie analyse exon 1, 2 en 3 (gehele coderende sequentie, inclusief flankerende intron gebieden)

-MLPA van exon 1 t/m 3 (P016-C2 kit, MRC-Holland)


Procedure :  

Indien de mutatie nog niet bekend is worden alle specifiek aangevraagde genen tegelijk ingezet, tenzij anders is aangegeven. Per gen wordt zowel sequentie analyse als MLPA standaard uitgevoerd (uitzondering:SDHAF2, zie tabel hierboven). Bij aanvraag voor gelijktijdige analyse van 3 of méér genen wordt het complete genpanel “Paragangliomen en/of feochromocytomen (PGL-panel)” ingezet.  


Detectie ratio:

Dit is een klinisch zeer heterogene groep patiënten. De detectie ratio voor pathogene mutaties : SDHD  in 35% van de patiënten, SDHA 9%, SDHB  7%, en SDHC  0,8%.  SDHAF2 , TMEM127, MAX, VHL en RET zijn in een te kleine groep patienten onderzocht om hier een representatieve detectie ratio te geven.


Gen

Genproduct

Locus

Overerving

OMIM nummer

Referentiesequentie

SDHD

Succinate dehydrogenase complex, subunit D

11q23.1

Autosomaal dominant, alleen verhoogd risico op tumoren indien de mutatie van vader komt

602690

NT_033899.7  NM_003002.2

 

SDHB

Succinate dehydrogenase complex, subunit B

1p36.13

Autosomaal dominant

185470

NT_004610.18 NM_003000.2

 

SDHC

Succinate dehydrogenase complex, subunit C

1q23.3

Autosomaal dominant

602413

NT_004487.18 NM_003001.3

SDHA

Succinate dehydrogenase complex, subunit A

5p15.33

Autosomaal dominant

600857

NC_000005.9 NM_04168.2

SDHAF2

Succinate dehydrogenase Complex Assembly Factor 2

11q12.2

Autosomaal dominant, alleen verhoogd risico op tumoren indien de mutatie van vader komt

613019

NC_000011.9, NM_017841.1

 

MAX

MYC Associated Factor X

14q23.3

Autosomaal dominant, waarschijnlijk alleen verhoogd risico op tumoren indien de mutatie van vader komt

154950

NG_029830.1, NM_002382.3

TMEM127

TransMembrane protein 127

2q11.2

Autosomaal dominant

613403

NG_027695.1, NM_017849.3

RET

Rearranged during transfection protooncogene

10q11.21

Autosomaal dominant

164761

NC_000010.10, NM_020975.4

VHL

VHL gene

3p25.3

Autosomaal dominant

608537

NC_000003.12, NM_000551.3


Website links:

Patiënten materiaal insturen

Uitslagtermijnen laboratoriumonderzoek


Databases / links:

www.LOVD.nl/SDHD ; www.LOVD.nl/SDHB; www.LOVD.nl/SDHC; www.LOVD.nl/SDHA; www.LOVD.nl/SDHAF2; www.lovd.nl/MAX; www.LOVD.nl/TMEM127; www.lovd.nl/VHL; www.lovd.nl/RET