Sotos, Sotos-like, Marshall-Smith, Luscan-Lumish, Tatton-Brown-Rahman, Weaver syndroom

 

OMIM:

Sotos syndroom                                   : 117550

Sotos-like syndroom (Sotos syndroom 2): 614753

Marshall-Smith syndroom                     : 602535

Luscan-Lumish syndroom                     : 616831

Tatton-Brown-Rahman syndroom         : 615879

Rahman syndroom                               : 617537

Weaver syndroom                                 : 277590

 

Gen

Technieken

NSD1

·          Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 23) inclusief intron/exon overgangen.

  • MLPA exon 1 t/m 23 (MRC-Holland kit P026-E1) voor de detectie van deleties en duplicaties

NFIX

  • Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 11) inclusief intron/exon overgangen
  • MLPA exon 2 t/m 11 (P026-E1) voor de detectie van deleties en duplicaties

SETD2

  • Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 1 t/m 21) inclusief intron/exon overgangen

DNMT3A

  • Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 23) inclusief intron/exon overgangen

HIST1H1E

  • Sequentie analyse exon 1 inclusief intron/exon overgangen

EZH2

  • Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 20) inclusief intron/exon overgangen

Procedure :

Voor Sotos syndroom diagnostiek wordt zowel sequentie analyse als MLPA standaard uitgevoerd. Indien geen mutatie wordt gevonden is ook diagnostiek mogelijk van NFIX, SETD2, DNMT3A en HIST1H1E (Sotos-like syndroom) en EZH2 (Weaver syndroom).

Voor Sotos-like en Marshall-Smith syndroom  wordt dezelfde procedure uitgevoerd, er wordt zowel sequentie analyse als MLPA van NFIX standaard uitgevoerd. Daarnaast  wordt sequentie analyse verricht van SETD2 (Luscan-Lumish syndroom), DNMT3A (Tatton-Brown-Rahman syndroom) en HIST1H1E (Rahman syndroom).

Voor W eaver syndroom (EZH2) wordt geen MLPA uitgevoerd omdat er alleen missense mutaties, en truncerende mutaties in het laatste exon zijn beschreven bij patienten met dit syndroom (zie Tatton-Brown and Rahman 2013).

  

Detectie ratio:  

Sotos syndroom 1: Ongeveer 33%, hoger bij sterke klinische verdenking

Sotos-like syndroom: lijkt redelijk zeldzaam, maar er is nog niet veel over bekend (Zie ook Malan et al., 2010)

Marshall-Smith syndroom: hoog (Zie ook Malan et al., 2010)

Weaver syndroom: Nog niet bekend, deze diagnostiek is nog nieuw

 

 

Gen

Genproduct

Locus

Overerving

OMIM nummer

Referentiesequentie

NSD1

Nuclear receptor binding SET domain protein

5q35.2-q35.3

Autosomaal dominant, de novo

606681

NSD1

NFIX

Nuclear factor I/X

19p13.2

Autosomaal dominant, de novo (beide aandoeningen)

164005

NC_000019.9, ENST00000592199.1 (dit transcript omvat ook NM_002501.2).

SETD2

SET domain-containing protein 2

3p21.31

Autosomaal dominant, de novo

612778

NC_000003.12, NM_014159.6

DNMT3A

DNA methyltransferase

2p23.3

Autosomaal dominant, de novo

602769

NC_000002.12, NM_022552.4

HIST1H1E

Histone gene cluster 1, h1 histone family, member e

6p22.2  

Autosomaal dominant

142220

NC_000006.11, NM_005321.2

EZH2

Enhancer of Zeste Homolog 2

7q36.1

Autosomaal dominant, de novo

601573

NG_032043.1, NM_004456.4

 

Website links:

Sending patient material

Laboratory turnaround times

 

DaDatabases / links:

 

·          Tatton-Brown K, Rahman N. The NSD1 and EZH2 overgrowth genes, similarities and differences. Am J Med Genet C Semin Med Genet. 2013;163C(2):86-91.