Sotos, Sotos-like, Marshall-Smith, Luscan-Lumish, Tatton-Brown-Rahman, Weaver syndroom
OMIM:
Sotos syndroom : 117550
Sotos-like syndroom (Sotos syndroom 2): 614753
Marshall-Smith syndroom : 602535
Luscan-Lumish syndroom : 616831
Tatton-Brown-Rahman syndroom : 615879
Rahman syndroom : 617537
Weaver syndroom : 277590
Gen | Technieken |
NSD1 | · Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 23) inclusief intron/exon overgangen.
|
NFIX |
|
SETD2 |
|
DNMT3A |
|
HIST1H1E |
|
EZH2 |
|
Procedure :
Voor Sotos syndroom diagnostiek wordt zowel sequentie analyse als MLPA standaard uitgevoerd. Indien geen mutatie wordt gevonden is ook diagnostiek mogelijk van NFIX, SETD2, DNMT3A en HIST1H1E (Sotos-like syndroom) en EZH2 (Weaver syndroom).
Voor Sotos-like en Marshall-Smith syndroom wordt dezelfde procedure uitgevoerd, er wordt zowel sequentie analyse als MLPA van NFIX standaard uitgevoerd. Daarnaast wordt sequentie analyse verricht van SETD2 (Luscan-Lumish syndroom), DNMT3A (Tatton-Brown-Rahman syndroom) en HIST1H1E (Rahman syndroom).
Voor W eaver syndroom (EZH2) wordt geen MLPA uitgevoerd omdat er alleen missense mutaties, en truncerende mutaties in het laatste exon zijn beschreven bij patienten met dit syndroom (zie Tatton-Brown and Rahman 2013).
Detectie ratio:
Sotos syndroom 1: Ongeveer 33%, hoger bij sterke klinische verdenking
Sotos-like syndroom: lijkt redelijk zeldzaam, maar er is nog niet veel over bekend (Zie ook Malan et al., 2010)
Marshall-Smith syndroom: hoog (Zie ook Malan et al., 2010)
Weaver syndroom: Nog niet bekend, deze diagnostiek is nog nieuw
Gen | Genproduct | Locus | Overerving | OMIM nummer | Referentiesequentie |
NSD1 | Nuclear receptor binding SET domain protein | 5q35.2-q35.3 | Autosomaal dominant, de novo | 606681 | NSD1 |
NFIX | Nuclear factor I/X | 19p13.2 | Autosomaal dominant, de novo (beide aandoeningen) | 164005 | NC_000019.9, ENST00000592199.1 (dit transcript omvat ook NM_002501.2). |
SETD2 | SET domain-containing protein 2 | 3p21.31 | Autosomaal dominant, de novo | 612778 | NC_000003.12, NM_014159.6 |
DNMT3A | DNA methyltransferase | 2p23.3 | Autosomaal dominant, de novo | 602769 | NC_000002.12, NM_022552.4 |
Histone gene cluster 1, h1 histone family, member e | 6p22.2 | Autosomaal dominant | 142220 | NC_000006.11, NM_005321.2 |
|
EZH2 | Enhancer of Zeste Homolog 2 | 7q36.1 | Autosomaal dominant, de novo | 601573 | NG_032043.1, NM_004456.4 |
Website links:
DaDatabases / links:
- LOVD: https://databases.lovd.nl/shared/variants/NSD1/unique
- Malan, V. et al. Distinct effects of allelic NFIX mutations on nonsense-mediated mRNA decay engender either a Sotos-like or a Marshall-Smith syndrome. Am J Hum Genet. 201013;87(2):189-98.
· Tatton-Brown K, Rahman N. The NSD1 and EZH2 overgrowth genes, similarities and differences. Am J Med Genet C Semin Med Genet. 2013;163C(2):86-91.