Sotos, Sotos-like, Marshall-Smith, Luscan-Lumish, Tatton-Brown-Rahman, Weaver syndroom

 

OMIM:

Sotos syndroom                                   : 117550

Sotos-like syndroom (Sotos syndroom 2): 614753

Marshall-Smith syndroom                     : 602535

Luscan-Lumish syndroom                     : 616831

Tatton-Brown-Rahman syndroom         : 615879

Rahman syndroom                               : 617537

Weaver syndroom                                 : 277590

 

Gen	Technieken
NSD1	·          Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 23) inclusief intron/exon overgangen. MLPA exon 1 t/m 23 (MRC-Holland kit P026-E1) voor de detectie van deleties en duplicaties
NFIX	Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 11) inclusief intron/exon overgangen MLPA exon 2 t/m 11 (P026-E1) voor de detectie van deleties en duplicaties
SETD2	Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 1 t/m 21) inclusief intron/exon overgangen
DNMT3A	Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 23) inclusief intron/exon overgangen
HIST1H1E	Sequentie analyse exon 1 inclusief intron/exon overgangen
EZH2	Sequentie analyse van de gehele coderende regio (exon 2 t/m 20) inclusief intron/exon overgangen

Procedure :

Voor Sotos syndroom diagnostiek wordt zowel sequentie analyse als MLPA standaard uitgevoerd. Indien geen mutatie wordt gevonden is ook diagnostiek mogelijk van NFIX, SETD2, DNMT3A en HIST1H1E (Sotos-like syndroom) en EZH2 (Weaver syndroom).

Voor Sotos-like en Marshall-Smith syndroom  wordt dezelfde procedure uitgevoerd, er wordt zowel sequentie analyse als MLPA van NFIX standaard uitgevoerd. Daarnaast  wordt sequentie analyse verricht van SETD2 (Luscan-Lumish syndroom), DNMT3A (Tatton-Brown-Rahman syndroom) en HIST1H1E (Rahman syndroom).

Voor W eaver syndroom (EZH2) wordt geen MLPA uitgevoerd omdat er alleen missense mutaties, en truncerende mutaties in het laatste exon zijn beschreven bij patienten met dit syndroom (zie Tatton-Brown and Rahman 2013).

  

Detectie ratio:  

Sotos syndroom 1: Ongeveer 33%, hoger bij sterke klinische verdenking

Sotos-like syndroom: lijkt redelijk zeldzaam, maar er is nog niet veel over bekend (Zie ook Malan et al., 2010)

Marshall-Smith syndroom: hoog (Zie ook Malan et al., 2010)

Weaver syndroom: Nog niet bekend, deze diagnostiek is nog nieuw

 

 

Gen	Genproduct	Locus	Overerving	OMIM nummer	Referentiesequentie
NSD1	Nuclear receptor binding SET domain protein	5q35.2-q35.3	Autosomaal dominant, de novo	606681	NSD1
NFIX	Nuclear factor I/X	19p13.2	Autosomaal dominant, de novo (beide aandoeningen)	164005	NC_000019.9, ENST00000592199.1 (dit transcript omvat ook NM_002501.2).
SETD2	SET domain-containing protein 2	3p21.31	Autosomaal dominant, de novo	612778	NC_000003.12, NM_014159.6
DNMT3A	DNA methyltransferase	2p23.3	Autosomaal dominant, de novo	602769	NC_000002.12, NM_022552.4
HIST1H1E	Histone gene cluster 1, h1 histone family, member e	6p22.2	Autosomaal dominant	142220	NC_000006.11, NM_005321.2
EZH2	Enhancer of Zeste Homolog 2	7q36.1	Autosomaal dominant, de novo	601573	NG_032043.1, NM_004456.4

 

Website links:

Sending patient material

Laboratory turnaround times

 

DaDatabases / links:

• LOVD: https://databases.lovd.nl/shared/variants/NSD1/unique
• Malan, V. et al. Distinct effects of allelic NFIX mutations on nonsense-mediated mRNA decay engender either a Sotos-like or a Marshall-Smith syndrome. Am J Hum Genet. 201013;87(2):189-98.

 

·          Tatton-Brown K, Rahman N. The NSD1 and EZH2 overgrowth genes, similarities and differences. Am J Med Genet C Semin Med Genet. 2013;163C(2):86-91.