PhD-kandidaat Artificial Intelligence (AI) bij Diagnostiek Baarmoederkanker

Onderzoek & onderwijs

Je functie

Of een patiënt met baarmoederkanker na verwijdering van de baarmoeder nog bestraling of chemotherapie krijgt, is vooral gebaseerd op een beoordeling van de tumor door de patholoog. De afdeling Pathologie van het  LUMC gaat onderzoeken hoe we met behulp van kunstmatige intelligentie deze beoordeling kunnen verbeteren. Beschik jij over de juiste kennis en ervaring om dit onderzoek tot een succes te maken?

In het kort

• Je werk samen met experts op het gebied van diagnostiek en behandeling van baarmoederkanker en op het gebied van kunstmatige intelligentie.
• Je gaat AI-gestuurde computermodellen ontwikkelen op basis van microscopiebeelden van s ‘werelds grootste baarmoederkanker dataset
• Dit onderzoek is uniek en niet eerder uitgevoerd
• De door jou ontwikkelde modellen zullen de diagnostiek, behandeling en daarmee uitkomsten van patiënten met baarmoederkanker verbeteren

Wat ga je doen?

Baarmoeder (endometrium) kanker is de meest voorkomende gynaecologische kanker in de westerse wereld, met alleen al in Europa jaarlijks ruim 100.000 nieuwe patiënten. Gelukkig is het grootste deel van deze patiënten te genezen door het chirurgisch verwijderen van de baarmoeder. Een groot probleem in de behandeling is echter dat het moeilijk te voorspellen is welke patiënten voordeel hebben van aanvullende behandelingen, zoals radio- en/of chemotherapie. Een veelbelovende nieuwe tak van kankeronderzoek is het inzetten van kunstmatige intelligentie voor verbeterde diagnostiek. Recente voorbeelden tonen aan dat computers uitstekend in staat zijn om patronen te herkennen in microscopische beelden en hieraan ook voorspellingen kunnen verbinden. Dit is voor baarmoederkanker nog nooit ingezet en wij willen onderzoeken of kunstmatige intelligentie de huidige diagnostiek en dus risico-inschatting kan ondersteunen en zelfs verbeteren. Wij hebben de unieke mogelijkheid om hiervoor s ’werelds grootste tumorweefselbank te kunnen gebruiken die bestaat uit endometriumtumoren van vrouwen die geparticipeerd hebben aan de PORTEC-studies. Het LUMC beschikt over de benodigde computers, servers en opslagruimte om de plannen in dit project te kunnen realiseren. Jij wordt als PhD-student de spil van het AIR-MEC-projectteam, waarbij je ook steun zal krijgen van een postdoc die ook op dit project wordt aangenomen. Jij gaat AI-modellen maken die op basis van microscopiebeelden kunnen voorspellen welke moleculaire veranderingen aanwezig zijn in de tumor, op welke behandeling de tumor zal reageren en modellen die de prognose van de patiënt kan voorspellen. Maar AIR-MEC gaat verder, je gaat ook beoordelen op basis van welke beeld parameters de door jou ontwikkelde AI-modellen voorspellingen doen. Deze mogelijk nog onbekende maar belangrijke tumoreigenschappen ga jij verder moleculair onderzoeken, zodat je bijdraagt aan een beter begrip van baarmoederkanker. Het AIR-MEC-team bestaat verder uit de wereldexperts op het gebied van diagnostiek en behandeling van baarmoederkanker, die zullen ondersteunen bij de juiste klinische interpretatie en op termijn implementatie van de ontwikkelde modellen.

Wat vragen wij?

Wij zijn op zoek naar een enthousiaste en toegewijde collega met enige ervaring met programmeren en affiniteit met machine learning en AI-gestuurde computermodellen. Je hebt een masteropleiding afgerond in de richting van (technische)geneeskunde, kunstmatige intelligentie, computerwetenschappen, data science of vergelijkbaar. Ervaring of affiniteit met oncologie, gynaecologie, pathologie of moleculaire biologie is geen must, maar is wel een pre. Je bent in staat je te verplaatsen in klinische vraagstukken en beschikt over goede communicatieve vaardigheden. Je hebt een proactieve en inventieve mindset en wil je de komende vier jaar inzetten om toekomstige diagnostiek en behandeling van baarmoederkankerpatiënten te verbeteren.

Meer informatie

Je werkt in een dienstverband van 36 uur per week. Het salaris begint met € 2.495,- bruto per maand in het eerste jaar, oplopend tot € 3.196,- bruto per maand in het vierde jaar (schaal OIO, CAO UMC).
Voor deze AIR-MEC-studie krijgen wij een subsidie van het Hanarth Fonds. Dit fonds wil het gebruik van kunstmatige intelligentie en machine learning bevorderen en verbeteren om de diagnose, behandeling en uitkomst van patiënten met kanker te verbeteren.

AIR-MEC wordt uitgevoerd in samenwerking met patholoog Viktor Koelzer van de Universiteit van Zurich, Jouke Dijkstra van de afdeling Radiologie en Carien Creutzberg van de afdeling Radiotherapie.
Voor deze vacature kunnen we referenties opvragen. 

Het geven van een presentatie behoort tot de procedure.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.

Esmee Stoop, IT-specialist

Esmee Stoop

"Op de IT-afdeling werken we aan de rand van de wetenschap."

Je werkplek

Je werkplek zal primair op de afdeling Pathologie van het LUMC zijn, waarbij je onderdeel uitmaakt van de onderzoeksgroep Gynaecologische Tumoren. Deze groep bestaat uit een Postdoc, vier tot zes PhD-kandidaten, twee analisten en enkele student-stagiaires. In dit project zal nauw samengewerkt worden met het laboratorium voor klinische en experimentele beeldverwerking (LKEB) alsmede met de Universiteit van Zurich. Een stageperiode bij prof. Koelzer in Zurich is gewenst.

Carrière in het LUMC

Het LUMC faciliteert bij het onderhouden en ontwikkelen van je kennis en vaardigheden. Hiervoor bieden wij onder andere interne opleidingen en bijscholing aan. Maar ook persoonlijke ontwikkeling, mobiliteit en loopbaanadvies maken deel uit van deze afspraken.

Contact: dr. Tjalling Bosse, medisch specialist, afdeling Pathologie
071 526 66 21

Solliciteren