Afdeling

Biomedical Data Sciences

De afdeling Biomedical Data Sciences in het LUMC voert toonaangevend onderzoek uit en levert hoogwaardig onderwijs. De afdeling combineert expertise op het gebied van medische statistiek, moleculaire epidemiologie, medische besliskunde en datamanagement.
Onderwijs

De afdeling Biomedical Data Sciences verzorgt onderwijs in het Geneeskunde en Biomedische Wetenschappen curriculum:

  • Medische Statistiek;
  • Data Management;
  • Moleculaire Epidemiologie;
  • En Medische Besliskunde

De afdeling biedt cursussen aan in het Masterplus programma, voor medische onderzoekers van binnen en buiten het LUMC.

Daarnaast geeft de sectie Medische Statistiek een deel van het onderwijs in de Master Statistics & Data Science en  in de Master Population Health Management

De afdeling Biomedical Data Sciences verzorgt onderwijs in het Geneeskunde en Biomedische Wetenschappen curriculum:

  • Medische Statistiek;
  • Data Management;
  • Moleculaire Epidemiologie;
  • En Medische Besliskunde

De afdeling biedt cursussen aan in het Masterplus programma, voor medische onderzoekers van binnen en buiten het LUMC.

Daarnaast geeft de sectie Medische Statistiek een deel van het onderwijs in de Master Statistics & Data Science en  in de Master Population Health Management

Stages en afstudeerprojecten

De afdeling Biomedical Data Sciences biedt stage- en afstudeerprojecten aan voor studenten Geneeskunde, Biomedische Wetenschappen, (Medische) Biologie, Bioinformatica/Data Science, Statistiek (en eventueel uit andere richtingen zoals Psychologie). Ook voor HBO studenten zijn projecten beschikbaar.

Contactpersonen hiervoor zijn:

  • dr. Eline Slagboom (Moleculaire Epidemiologie)
  • Roula Tsonaka (Medische Statistiek)
  • Dr. Anne Stiggelbout (Medische Besliskunde)
  • Dr. K.M. van der Pal (Advanced Data Management)

Research

The department of Biomedical Data Sciences consists of four sections. On this website, information on research of the department is split up by section.

Over de afdeling

Contact

Secretariaat

Inge ten Hoorn, Leonie Oudshoorn
Locatie: S-05-003
Postzone S-05-P

Aubry Leiwakabessy
Locatie: J-10-081
Postzone: J-10-R

Volg ons op social media

Team

Medische Statistiek

  • prof. dr. E.W. (Ewout) Steyerberg (Afdelingshoofd)
    klinische biostatistiek
    medische besliskunde
    focus op predictiemodellen
  • L. (Leonie) Oudshoorn (Managementassistent)
    medische statistiek
    advanced data management
  • dr. S. (Stefan) Böhringer (Assistant professor)
    statistical genetics
    computational statistics
    high-performance computation & automated analysis
  • drs. E.F. (Edouard) Bonneville (PhD Student)
    Survival analysis
    Competing risks and multi-state models
    Missing data
    Infectious disease modelling / forecasting
  • S. (Said) el Bouhaddani (PhD Student)
    high dimensional statistics
    data integration
    latent variable modeling
    meta analysis and imputation in high dimensions
  • prof. dr S. (Saskia) le Cessie (Full professor of statistical methods in clinical epidemiology)
    epidemiology
    medical statistics
    observational studies
    causal inference
  • dr. X. (Xu) Chen
    fMRI data analysis
    multiple testing
  • drs. C. (Chengyuan) Lu
  • M. (Mitra) Ebrahimpoor
  • prof. dr. M. (Marta) Fiocco (Hoogleraar Toegepaste Wiskunde)
    medical Statistics
    survival analysis
    meta analysis
    frailty models
    counting processes
  • A.M. (Angga Muhamad) Fuady (PhD Student)
    statistical genetics
    RNA Sequencing Analysis
    statistical modeling
  • dr. ir. N. (Nan) van Geloven (biostatisticus)
    survival analysis
    causal inference
    dynamic prediction
    clinical trials
    evaluation of treatment timing
  • prof. dr. J. (Jelle) Goeman (Hoogleraar Biostatistiek)
    hoog-dimensionele data
    meervoudig hypothesetoetsen
    regression met veel variabelen
    statistische bioinformatica
  • dr. S.M. (Szymon) Kielbasa (Assistant Professor, Coordinator of Bioinformatics Center for Expertise)
  • I. (Ivonne) Martin (PhD Student)
    human - gut microbiome
    repeated - measurement study
    joint modelling of mixed outcomes
  • dr. B. (Bart) Mertens (Biostatistician)
    statistical methods for high-dimensional omics (proteomics, metabolomics, lipidomics)
    prediction with missing values
    bayesian statistics
  • drs. R. (Ramin) Monajemi (Senior researcher)
    bio-informatica
  • drs. X. (Ningning) Xu
  • drs. S. (Susanne) Pinto
  • prof. dr. H. (Hein) Putter (Hoogleraar, wetenschappelijk staflid)
    medische statistiek
  • dr. M.D.M. (Mar) Rodriguez-Girondo (Assistant Professor)
    medical statistics
    prediction and classification with omics data
    survival analysis
    family data
  • dr. S. (Roula) Tsonaka (Statistician)
    models for longitudinal omics
    RNAseq
    analysis of clustered data (e.g. families)
    genetic association studies: gene-set/pathway-based analyses
  • prof. dr. J. (Jacco) Wallinga (Professor modellering van infectieziekten)
    statische analyse van infectieziekten gegevens
  • dr. L.C. (Liesbeth) de Wreede (statisticus)
    medische statistiek
    survivalanalyse
    competing risks en multi-state modellen
    klinische studies in de hematologie
  • dr. E.W. (Erik) van Zwet (Associate professor)
    medische statistiek
    meta-science

Medische Statistiek

  • prof. dr. E.W. (Ewout) Steyerberg (Afdelingshoofd)
    klinische biostatistiek
    medische besliskunde
    focus op predictiemodellen
  • L. (Leonie) Oudshoorn (Managementassistent)
    medische statistiek
    advanced data management
  • dr. S. (Stefan) Böhringer (Assistant professor)
    statistical genetics
    computational statistics
    high-performance computation & automated analysis
  • drs. E.F. (Edouard) Bonneville (PhD Student)
    Survival analysis
    Competing risks and multi-state models
    Missing data
    Infectious disease modelling / forecasting
  • S. (Said) el Bouhaddani (PhD Student)
    high dimensional statistics
    data integration
    latent variable modeling
    meta analysis and imputation in high dimensions
  • prof. dr S. (Saskia) le Cessie (Full professor of statistical methods in clinical epidemiology)
    epidemiology
    medical statistics
    observational studies
    causal inference
  • dr. X. (Xu) Chen
    fMRI data analysis
    multiple testing
  • drs. C. (Chengyuan) Lu
  • M. (Mitra) Ebrahimpoor
  • prof. dr. M. (Marta) Fiocco (Hoogleraar Toegepaste Wiskunde)
    medical Statistics
    survival analysis
    meta analysis
    frailty models
    counting processes
  • A.M. (Angga Muhamad) Fuady (PhD Student)
    statistical genetics
    RNA Sequencing Analysis
    statistical modeling
  • dr. ir. N. (Nan) van Geloven (biostatisticus)
    survival analysis
    causal inference
    dynamic prediction
    clinical trials
    evaluation of treatment timing
  • prof. dr. J. (Jelle) Goeman (Hoogleraar Biostatistiek)
    hoog-dimensionele data
    meervoudig hypothesetoetsen
    regression met veel variabelen
    statistische bioinformatica
  • dr. S.M. (Szymon) Kielbasa (Assistant Professor, Coordinator of Bioinformatics Center for Expertise)
  • I. (Ivonne) Martin (PhD Student)
    human - gut microbiome
    repeated - measurement study
    joint modelling of mixed outcomes
  • dr. B. (Bart) Mertens (Biostatistician)
    statistical methods for high-dimensional omics (proteomics, metabolomics, lipidomics)
    prediction with missing values
    bayesian statistics
  • drs. R. (Ramin) Monajemi (Senior researcher)
    bio-informatica
  • drs. X. (Ningning) Xu
  • drs. S. (Susanne) Pinto
  • prof. dr. H. (Hein) Putter (Hoogleraar, wetenschappelijk staflid)
    medische statistiek
  • dr. M.D.M. (Mar) Rodriguez-Girondo (Assistant Professor)
    medical statistics
    prediction and classification with omics data
    survival analysis
    family data
  • dr. S. (Roula) Tsonaka (Statistician)
    models for longitudinal omics
    RNAseq
    analysis of clustered data (e.g. families)
    genetic association studies: gene-set/pathway-based analyses
  • prof. dr. J. (Jacco) Wallinga (Professor modellering van infectieziekten)
    statische analyse van infectieziekten gegevens
  • dr. L.C. (Liesbeth) de Wreede (statisticus)
    medische statistiek
    survivalanalyse
    competing risks en multi-state modellen
    klinische studies in de hematologie
  • dr. E.W. (Erik) van Zwet (Associate professor)
    medische statistiek
    meta-science

Moleculaire Epidemiologie

  • prof. dr. P.E. (Eline) Slagboom (Sectiehoofd van de Moleculaire Epidemiologie)
    moleculaire epidemiologie
    genetica
    metabolomics
    verouderingsonderzoek
  • I.C.M. (Inge) ten Hoorn (Managementassistent)
    moleculaire epidemiologie
  • prof. dr. I. (Ingrid) Meulenbelt (Hoogleraar Moleculaire Biologie van Artrose)
    moleculaire epidemiologie
    genetica
    artrose
  • dr. ir. E.B. (Erik) van den Akker (Universitair Docent Bioinformatica)
    moleculaire epidemiologie
    leiden computational biology center (LCBC)
  • dr. M. (Marian) Beekman (Senior Onderzoeker)
    moleculaire epidemiologie
    Biomarkers voor gezonde veroudering
    metabolomics
    Leiden Langleven Studie (verouderingsonderzoek)
    genoomwijde associatie studies
    genoomwijde linkage studies
    gen expressie
    biobanking
  • drs. N.M.A. (Niels) van den Berg (AIO)
    Multigenerational family studies
    Demography
    Genealogy
    Social history
    Healthy Ageing
    Statistics
    Genetics
  • D. (Daniele) Bizzarri, MSc (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    longevity
  • N.G.C. (Niek) Bloks (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    artrose
  • F.A. (Fatih) Bogaards (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    verouderingsonderzoek
  • I. (Ilja) Boone, MSc (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    artrose onderzoek
  • ing. D. (Davy) Cats (Bio-Informaticus)
    bio-informatica
    sequencing analysis support core (SASC)
  • dr. R. (Rodrigo) Coutinho de Almeida (Post-doctoraal Onderzoeker)
    bio-informatica
    artrose
  • drs. K.F. (Koen) Dekkers (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    epigenetica
  • Prof. dr. B.T. (Bas) Heijmans (Professor of Population Epigenomics)
  • drs. M. (Marcella) van Hoolwerff (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    artrose
  • drs. E. (Evelyn) Houtman (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    artrose
  • Dr. N.M.(Nicoline) Korthagen (Postdoctoraal Onderzoeker)
    moleculaire epidemiologie
    artrose
    inflammatie
    biomarkers
    ziekte modellen
  • ing. N. (Nico) Lakenberg
    moleculaire epidemiologie
  • dr. H. (Leon) Mei (Manager Sequencing Analysis Support Core - SASC)
    moleculaire epidemiologie
    sequencing analysis support core (SASC)
  • drs. S. (Stelios) Paraschiakos (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    data management
    verouderingsonderzoek
  • dr. Y.F.M. (Yolande) Ramos
    moleculaire epidemiologie
    onderzoeker
  • drs. N. (Nathalie) Reilly (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    hart- en vaatziekten
  • prof. dr. M.J.T. (Marcel) Reinders (Hoofd Leiden Computational Biology Center - LCBC)
  • Alejandro Rodriguez Ruiz MSc (AIO)
    moleculaire epidemiologie
  • L.J. (Lucy) Sinke (AIO)
    moleculaire epidemiology
    bioinformatics
    cardiovascular disease
  • dr. E. (Evie) van der Spoel (Post-doctoraal Onderzoeker)
  • drs. H.E.D. (Eka) Suchiman
    moleculaire epidemiologie
  • R.G.M. (Ritchie) Timmermans (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    artrose
  • P. (Pia) Todtenhaupt (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    epigenetics
    TwinLife
  • M. (Margo) Tuerlings (AIO)
    moleculaire epidemiologie
    artrose
  • dr. D. (Dina) Vojinovic-Dees (Postdoctoraal Onderzoeker)
  • R.H.P. (Ruben) Vorderman (Bio-informaticus)
    bio-informatica
    sequencing analysis support core (SASC)
  • drs. J.S. (Joyce) Vriezen (Programma manager)
    Programma manager VOILA
  • M.A.W. (Mathew) Nickel (AIO)

 

Medische Besliskunde

  • prof. dr. E.W. (Ewout) Steyerberg (Afdelingshoofd)
    klinische biostatistiek
    medische besliskunde
    focus op predictiemodellen
  • A.N. (Aubry) Leiwakabessy (Managementassistent)
    medische besliskunde
    onderwijsondersteuning en -coördinatie
    websitebeheer en contentcreatie
  • prof. dr. A.M. (Anne) Stiggelbout (Hoogleraar Medische Besliskunde)
    medische besliskunde
    patient preferenties
    gedeelde besluitvorming
    risico perceptie en risico communicatie
    klinimetrie
    psychometrie
  • prof. dr. M.W.J.M. (Michel) Wouters (Hoogleraar Kwaliteit van de oncologische zorg)
    datagedreven verbetering van patiëntuitkomsten
    uitkomstonderzoek
    'real world data' analyses
    kwaliteitsinstrumenten medisch specialistisch zorg
    clinical auditing
    waardegedreven zorg (VBHC)
  • dr. M.E. (Elske) van den Akker-van Marle (Gezondheidseconoom)
    gezondheidseconomie
    kosten-effectiviteitsanalyses
    kwaliteit van leven onderzoek
    ontwikkeling uitkomstmaten
  • dr. L. (Leti) van Bodegom-Vos (Implementatiedeskundige)
    implementatie
    de-implementatie
    kwaliteit van zorg
  • J. (Nanny) van Duijn-Bakker (onderzoeksassistent)
  • J.M. (Jan) Heijdra Suasnabar (Researcher)
    economische evaluaties
    survival analyse
  • dr. W.B. (Wilbert) van den Hout (Gezondheidseconoom)
  • S.M. (Sascha) Keij (OIO)
    gedeelde besluitvorming
    arts-patiënt communicatie
    gezondheidspsychologie
  • M. (Martha) Kidanemariam (arts-onderzoeker)
    waardegedreven zorg
    patiëntgerichte zorg
    gedeelde besluitvorming
  • A.A. (Anouk) Kruiswijk (OIO)
    wekedelen tumoren
    risico-predictiemodellen
    personaliseren van zorg
  • dr. P.J. (Perla) Marang-van de Mheen (Epidemioloog)
    kwaliteit van zorg
    patient veiligheid
  • dr. A.H. (Arwen) Pieterse (Communicatieonderzoeker)
    behandelvoorkeuren patiënten en zorgverleners
    besluitvorming over behandeling
    gedeelde besluitvorming
    arts-patiënt communicatie
  • E.K.J. (Esmée) van der Poort (OIO)
    ziekenhuiskosten
    waardegedreven zorg
    kosten-effectiviteitsanalyses
    gezondheidseconomie
  • J.K. (Jaap) Sont (associate professor)
    mHealth / eHealth
    patient registries
    patient centered care
    asthma, diabetes mellitus
  • D. (Dorine) van Staalduinen (OIO)
    value-based healthcare
    healthcare governance
    interprofessional collaboration
  • dr. T.H. (Thomas) Wieringa (Onderzoeker)
    patiënt-gecentreerde zorg
    gedeelde besluitvorming
    patiënt-gerapporteerde uitkomsten
    diabetes mellitus
    kanker
  • dr. A. (Anke) Woudstra (Onderzoeker)
    medische besliskunde
    geïnformeerde besluitvorming
    gedeelde besluitvorming
    gezondheidsvaardigheden
    screening
    klinimetrie

 

Advanced Data Management

  • dr. K.M. (Karin) van der Pal-de Bruin (Hoofd Sectie Advanced Data Management)
    datastewardship
    good research data management
    epidemiologie
    Castor en ProMISe
    privacy
    GRP
    FAIR data
    datamanagementplannen
  • L. (Leonie) Oudshoorn (Managementassistent)
    medische statistiek
    advanced data management
    dr. ir. T.M. Jansen (specialist medical research datamanagement)
    good research datamanagement
    database ontwerp
    Castor en ProMISe datamanagementsystemen
    klinische trials
    neurochirurgie clinical trials (SIPS groep)
    onderwijs in datamanagement
  • drs. K.R. (Karen) Kooijman (Designer medical research data management)
    good research data management
    database ontwerp
    Castor en ProMISe datamanagementsystemen
  • dr. ir. J. (Judith) Mannien (Coordinator medical research datamanagement)
    good research data management
    datastewardship
    FAIR data
    database ontwerp
    datamanagementplannen
    good research practice (GRP)
    privacy
    Castor en ProMISe datamanagementsystemen
    epidemiologie
    dataopschoning
    onderwijs in datamanagement
  • dr. M.J.C. (Martiene) Moester (Specialist medical research datamanagement)
    data stewardship
    good research data management
    FAIR data
    datamanagementplannen
    privacy
    sleutelbestanden, pseudonimiseren
    database ontwerp
    Castor en ProMISe datamanagementsystemen
    parelsnoer
  • dr. K. (Kristel) Schaap (Specialist medical research data management)
    database design
    good research data management
    dataopschoning
    Castor en ProMISe datamanagementsystemen
    Research Support Desk
    onderwijs
  • H.P. (Henk Pieter) Sierat (ICT Ontwikkelaar)
    databases
    koppelingen
    conversies
    programmeren
  • dr. N.R. (Niek) van Ulzen (Specialist medical research datamanagement)
    FAIR data
    datastewardship
  • dr. I. (Ineke) van der Veen (Coordinator medical research datamanagement)
    good research data management
    datastewardship
    FAIR data
    database ontwerp
    datamanagementplannen
    good research practice (GRP)
    privacy
    Castor en ProMISe datamanagementsystemen
    epidemiologie
    klinische trials
    dataopschoning
    onderwijs in datamanagement
    biobanken
  • R. (Rogier) van der Velde (Informatieanalist)
    good research data management
    database ontwerp
    privacy
    Castor en ProMISe datamanagementsystemen
    dataopschoning
  • D.C.M. (Dominique) Wanders, MSc (Specialist medical research datamanagement)
    good research datamanagement
    datastewardship
    FAIR data
    database ontwerp
    datamanagementplannen
    good research practice (GRP)
    privacy
    Castor en ProMISe datamanagementsystemen
    epidemiologie
    klinische trials
    dataopschoning
    onderwijs in datamanagement
  • R.E. (Richard) Zwaan (Designer medical research datamanagement)
    Database design
    Data uploads
    Castor and ProMISe data management systemen
    Klinische trials
    Privacy
    ProMISe user cursussen