Homepage website LUMC
Algemene informatie
PubMed, Web of Science, EMBASE etc.
Online tijdschriftenlijst, Tijdschriften etc.
Online boeken, Aanwinsten, Proefschriften en Redes
Adres, Openingstijden etc.
Frequent Asked Questions / Veelgestelde vragen
Links
Stel een vraag
Zoeken
Naar de website van de Universiteit Leiden

Walaeus BibliotheekFAQ > Reference Manager
wijzigingsdatum pagina: 2009-09-16

Frequently Asked Questions : Reference Manager


          · Wat is Reference Manager?
          · Nieuwe importfilters Cochrane (21/12/2006)
          · EMBASE (OVID) en Reference Manager (26-05-2008)
          · Nieuw Import Filter Web of Science Alerts (28/9/2006)
          · Foutmelding 'failed to log on to database' 
          · Problemen met een database: koppelingen vanuit Word naar RefMan bestand verdwenen
          · Waarom kan ik in de Term Manager niet alle opties gebruiken (grijze icoontjes) 
          · Netwerk versie en stand-alone versie RM 11
          · Link naar eigen PDF bestand gebruiken
          · Opgeven van een datum 'range' in 'Internet Search'
          · Probleem met openen RM8 database in RM9 ("database error 12049")
          · Extra Output Styles
          · Extra Import Filters
          · Draaien repair RM11
          · RM11 Zelf Output Style aanpassen/Zelf Output Style maken
 


Wat is Reference Manager?

Reference Manager is een programma waarin een of meer databases met literatuurbeschrijvingen kunnen worden opgezet. Deze databases kunnen onder meer worden gevuld met zoekresultaten uit PubMed, EMBASE, Web of Science en dergelijke. Ook bestaat de mogelijkheid zelfgetypte literatuurbeschrijvingen in te voeren.

In de RefMan-databases kunnen zoekacties worden uitgevoerd.

Een andere toepassing van Reference Manager is het toevoegen van citaties ( = references) aan Word-teksten, bijvoorbeeld aan wetenschappelijke artikelen. Deze mogelijkheid wordt Cite While You Write genoemd.

Daarbij worden artikelbeschrijvingen vanuit Reference Manager op de gewenste plaats in de Word-tekst ingevoerd.

Referentielijsten kunnen in een Output Style naar keuze (volgens de regels van een tijdschrift) gegenereerd worden.


Nieuwe Importfilters Cochrane (21-12-2006)

Er zijn nieuwe filters beschikbaar voor het in RefMan importeren van records uit de Cochrane Library.

Het gaat om filters voor:
-Cochrane Database of Systematic Reviews (CDSR) download
-CENTRAL and the Cochrane Methodology Register download
-DARE download
(klik met de rechtermuistoets op de link, kies optie "Save Target as")

Bron: http://www.cochrane.org/docs/import.htm


EMBASE (OVID) en Reference Manager (27/7/2006)

1. Direct export
Het ís mogelijk om vanuit EMBASE (OVID) referenties direct te exporteren naar RefMan.
Dat kan alleen als een speciaal invoerbestandje (Download) in de import-submap van RefMan geïnstalleerd wordt.
Daarvoor heb je de hulp van de ICT-contactpersoon van je afdeling nodig.
Na installatie gaat het exporteren als volgt:

Scroll in EMBASE in de resultaten van een zoekactie naar de Results Manager, in de linkerbalk van de pagina.
Vink de volgende keuzes aan:
   Results:              --wat je wilt--
   Fields:                Complete Reference
   Result Format:   Direct Export
   Actions:              Save
(Kies, indien nodig, Reference Manager in het Choose Destination-venster)
Kies de RefMan-database waarnaar je wilt exporteren.

2. Eerst opslaan, dan vanuit Reference Manager importeren
Als het niet mogelijk is om direct te exporteren (bijvoorbeeld omdat je zoekt op een computer waar geen RefMan aanwezig is, of omdat je het invoerbestandje niet geïnstalleerd hebt) kun je de resultaten vanuit EMBASE ook opslaan en ze later in RefMan importeren.

Scroll in EMBASE in de resultaten van een zoekactie naar de Results Manager, in de linkerbalk van de pagina.
Vink de volgende keuzes aan:
   Results:              --wat je wilt--
   Fields:                Complete Reference
   Result Format:   Reprint/Medlars
   Actions:             Save

Laat in het volgende scherm Windows Style Linefeeds aangevinkt.
Aanvinken van de optie Include Search Strategy? maakt voor het importeren in RefMan niet uit
Klik op continue.
De referenties worden nu (op een zelf gekozen plaats) onder de naam Cites.txt opgeslagen (je kunt ook een andere naam geven)
Het bestand Cites.txt kan in RefMan geïmporteerd worden met behulp een speciaal invoerbestandje (Download).

Je moet dat bestandje ergens op je computer opslaan.
Bij het importeren in RefMan moet je, in het scherm van Import Text File bij de optie Filter de opslagplaats aangeven.
In het venster Select Default Database  moet je EMBASE kiezen
 


Nieuw Import Filter Web of Science Alerts (28/9/2006)

In september 2006 is het Import Filter voor Alerts van Web of Science gewijzigd. Het betreft het filter voor het importeren van referenties die wekelijks vanuit Web of Science via e-mail worden verspreid.
U kunt het aangepaste filter downloaden via de rechter muisknop met de optie Save Target As ... .

In Reference Manager bij het importeren de optie "ISI Web of Knowledge Search Alerts" kiezen:


Foutmelding 'failed to log on  to database'

Een Reference Manager database bestaat uit 2 bestanden: 
- de database zelf, met extensie *.rmd
- een index bestand, met extensie *.rmx

Als het index bestand ontbreekt, of als het *.rmd en *.rmx bestand niet bij elkaar horen (bijv na een bestand gekopieerd te hebben naar een andere ) geeft Reference Manager een foutmelding zoals 'failed to log on to database'.

De oplossing:

  • Start Reference Manager zonder een bestand te openen.

  • Maak voor de zekerheid een kopie van het betreffend *.rmd bestand ([CTRL-C], [CTRL-V])

  • Kies: 'Tools' / 'Rebuild database' en selecteer het originele *.rmd bestand (via het '...' icoontje rechts bovenin), en kies 'Rebuild'.

Als alles goed gaat, is de database gecontroleerd en eventueel gerepareerd, en is een nieuw *.rmx bestand gecreëerd.
[19-07-2001]


Problemen met een database: koppelingen vanuit Word naar Refman bestand verdwenen.

Indien een Word document (met referenties) het contact kwijt raakt met de bijbehorende Reference Manager database door naams- of lokatie- verandering wordt de gebruiker gevraagd om de juiste database aan te wijzen. Het gaat vaak mis omdat men delen van het Word bestand kopieert en 'plakt' in een ander bestand zodat de 'hidden codes' verloren gaan. Als je in een Word document [ALT] F9 doet, zie je de verborgen tekst. Het knippen en plakken vernielt deze verborgen tekst. 

De oplossing voor deze problemen is de koppelingen (referenties) in het Word bestand opnieuw op te bouwen. Dat gaat als volgt:

  1. Kies in Word: 'Tools' / 'Reference Manager' / 'Revert to original text'. Kies in het tweede window: 'Revert All'.

  2. Kies in Word: 'Tools' / 'Reference Manager' / 'Scan document' -> 'Scan for Identifying text' of 'RefID's' afhankelijk van het 'Revert format' dat je bij 1] hebt gekozen (als de ene optie niet werkt, kan je eenvoudig de andere proberen).

  3. Nu kan de referentie-lijst weer gegenereerd worden ( 'Tools' / 'Reference Manager' / 'Generate Bibilography').

Eventueel kan met een 'schone lei' begonnen worden door na 1] het gehele bestand te selecteren [CTRL]-A ) en te kopieren ( [CTRL-C], [CTRL-V] ) naar een nieuw bestand, en daarna met 2] te vervolgen.
[19-07-2001]


Waarom kan ik in de Term Manager niet alle opties gebruiken (grijze icoontjes)?

De netwerk versie van Reference Manager maakt gezamelijk gebruik van databases mogelijk. Een gebruiker heeft 'read-write exclusive' rechten nodig om alle bewerkingen in de database te kunnen uitvoeren. 
Deze rechten kunnen geselecteerd worden bij het openen van de database:

°  Kies in Reference Manager 'File > Open Database'
°  Het 'Open Reference Manager Database' window verschijnt
°  Selecteer onderaan bij 'Access Rights' Read-Write Exclusive
°  Selecteer de gewenste database en kies 'Open'


Netwerk versie en stand-alone versie RM 11

Binnen het LUMC wordt standaard Reference Manager 11 aangeboden via het netwerk. 

°  In principe wordt in het LUMC gebruik gemaakt van de netwerk versie 
°  De netwerk versie is door uw systeem/netwerk-beheerder op uw divisionele fileserver geïnstalleerd. 
°  Alleen voor stand-alone PC's en voor thuisgebruik kan gebruik gemaakt worden van de stand-alone versie.
°  De stand-alone versie is beschikbaar bij het divisioneel steunpunt I&A. De installatie-CD kan daar GELEEND worden. Kopieren van de CD is niet toegestaan


Link naar eigen PDF bestand gebruiken in referentie

In een referentie die gevonden is d.m.v. Internet Search via Pubmed, bevat het WEB/URL veld een link naar meestal het abstract op de PubMed server. 
Het is ook mogelijk om in dit veld zelf een referentie te zetten, bijvoorbeeld naar een full-text bestand in PDF formaat op uw PC (of op de fileserver). 

Het is ook mogelijk om meer dan één URL op te nemen. De beide URL's dienen dan gescheiden te worden door 'punt/komma', ZONDER EEN SPATIE TUSSEN DE URL's.

 
[21-06-2000]


Opgeven van een datum 'range' in 'Internet Search'

Het opgeven van een datum-range in de 'internet search' van RefMan moet als volgt (bijvoorbeeld):

1999/01/01:1999/12/31
[18-06-2000]


Probleem met openen RM8 database in RM9 ("database error 12049")

Hier de oplossing voor het zeer veel optredende probleem bij het converteren van bestanden in Reference Manager 8 formaat naar versie 9 formaat (met behulp van Reference Manager 9):

In verband met het gebruik van de netwerk-versie van Reference Manager, die ook gezamenlijk gebruik van bestanden via het netwerk ondersteunt, is het noodzakelijk dat bij het converteren van een bestand de gebruiker 'read-write exclusive' rechten heeft voor dat bestand. Ga als volgt te werk:

1. In Reference Manager 9.0, kies: 'File', 'Open Database'
2. Het 'Open Reference Manager Database' window verschijnt
3. Selecteer onderaan: 'Access Rights' = 'Read-Write Exclusive'
4. Selecteer daar boven om wat voor tyype bestand het gaat (in dit geval: RM 8/9)
5. Selecteer het bewuste bestand, en kies 'Open'

Nu zou het goed moeten gaan!
[18-01-2000]


Extra Output Styles

Zie: 
www.refman.com/support/rmstyles.asp
 
en/of 
www.researchsoftware.nl/kb
(zie Reference Manager Output Styles)


Extra Import Filters

Zie: 
www.refman.com/support/rmfilters.asp
 
en/of
www.researchsoftware.nl/kb (zie Reference Manager Import Filters)